International Journal of Innovative Approaches in Science Research
Abbreviation: IJIASR | ISSN (Print): 2602-4810 | ISSN (Online): 2602-4535 | DOI: 10.29329/ijiasr

Volume 6 Issue 2 (June 2022)

Issue Information

Issue Information | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Issue Information

pp. i - vi   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454

Abstract

Keywords:

Original Articles

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Investigation on Biosynthesis of Phytosterol Compounds in Ayvalık Olive Variety (Olea europaea L.) During Ripening under Conventional and Organic Cultivation Conditions

Esra Rüveyda Özdemi̇r & Murat Şeker

pp. 23 - 33   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.1

Abstract

Olive oil obtained from the fruit of olive trees (Olea europaea L.) belonging to the Oleaceae family; basically consists of two parts: saponifiable and unsaponifiable parts. The saponifiable fraction represents about 98% by weight of the oil. On the contrary, the unsaponifiable fraction constitutes about 2% of the total oil weight.

Phytosterols constitute the largest part of the unsaponifiable fraction and are the most important parameter to establish the purity of olive oil. Olive oil quality is affected by many factors, the most important being the ripening stage. Phytosterol content changes with maturation. Because the metabolic events in its structure continue until the fruit ripens. This study was carried out in Ayvalık olive variety grown with organic and conventional growing techniques during the 2019 and 2020 seasons. Fruits obtained from Geyikli region of Çanakkale province were harvested in 8 different maturity stages (September– December) at 15-day intervals. Phytosterol contents of fruits and changes in phytosterols in olive ripening process were determined periodically by gas chromatography-mass spectrophotometer (GC-MS) technique.

At the end of the study, the total phytosterol content of the fruits harvested from both conventional and organic orchards during both production seasons in both years, depending on the maturity index. Phytosterol components were found to increase regularly until December, but it decrease after December. While the maximum total sterol amount was determining 2.008 g kg-1 on 08.12.2019, it was 2.520 g kg-1 on 06.12.2020. After this date, it was observed that the total sterol content decreased as a result of over-ripening.

Keywords: Olea europaea L., Maturity Index, Total sterol, Sterol components, β-sitosterol, chromatography

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
A Computational Study: Structural and Electronic Properties of Some Transition Metal Doped Bilayer Graphene Systems

Özlem Ünlü & İzzet Amour Morkan

pp. 34 - 46   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.2

Abstract

Graphene, which is accepted as the main material of nanomaterials, attracts great attention thanks to its applicability in almost every field and its superior properties. The zero-band graphene gap is a problem that scientists must overcome in designing new electronics. Tailoring the electronic properties of graphene systems by making a change in the band gap allow us great advantages. In this study, Intercalation of transition metal (TM) atom to graphene systems as sandwich-like graphene|TM|graphene structures were investigated by  ab initio first principle Density Functional Theory (DFT) computations. GGA with BPW91 basis set were used for DFT calculations. DFT calculations were performed on W, Re, and Os transition metal atoms intercalted between bilayer graphene (BLG). After geometry optimization of graphene|TM|graphene structures, graphene layers doped with nitrogen atoms by substitutional doping for investigation of change in electronic behavior.  The electronic behaviour of metal intercalated BLG structures can be modified by type of transition metal and dopant as a result of charge transfer. Substitutional doping with nitrogen atoms to graphene structures showed a change in local density due to the charge transfer as a result of its extra one electron. Placing a transition metal atom between BLG layers leads to constriction in the band gap with a boost in conductive character.

Keywords: Graphene|TM|graphene , band gap opening, bilayer graphene systems, DFT

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Behaviour of Magnetized Strange Quark Matter in f(R,T) Theory for General Kantowski-Sachs Model

Hüsnü Baysal, Sezgin Aygün, İhsan Yılmaz & Can Aktaş

pp. 46 - 63   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.3

Abstract

In this study, we have investigated the behavior of magnetized strange quark matter (MSQM) in f(R,T) gravity for LRS Bianchi I, Bianchi III and Kantowski-Sachs (GKS) universe models with cosmological term. For the solutions of modified field equations, we have used linearly varying deceleration parameter (LVDP), anisotropy parameter and equation of state for strange quark matter. When the models goes to the isotropy magnetic field only occurs in Bianchi III and Kantowski-Sachs universe models. When t→∞, strange quark matter distribution behaves like dark energy. The K(θ) parameter, which allows us to obtain different universe models, is effective on the magnetic field, cosmological term and f(R,T) function. In addition, the graphics of the obtained results were examined in detail.

Keywords: f(R, T) gravitation theory, General Kantowski-Sachs universe, Magnetic field, Linear deceleration parameter

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Identification and Bioinformatic Analysis of CAMTA Genes in Olive (Olea europaea L.)

Aslıhan Özbilen

pp. 64 - 78   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.4

Abstract

Calcium is a secondary messenger which involves in stress response, adaptation, development and signaling pathways in plants. In cells, calcium is captured by calmodulin and after a conformation change, calmodulin becomes able to target calmodulin binding transcription factors. The calmodulin-binding transcriptional activators (CAMTAs) are one of these calmodulin binding transcription factors and they have CG-1, TIG, ANK, CaMBD and IQ conserved domains. CAMTAs are studied well in lots of plant species, and they are found to be involved in stress responses like drought, cold, salt and hormone responses like ethylene, abscisic acid, auxin, and gibberellin. In this study, CAMTA genes and proteins are characterized in olive. Olive (Olea europaea L.) is a Mediterranean commercially important crop, and this is the first study on olive CAMTAs. 7 CAMTA genes are found in olive in total in this study. Then, the cis-actin regulatory elements in the promoter regions of these genes are analyzed. Stress and hormone response related elements in the promoter regions are found, suggesting possible stress and hormone response roles of CAMTAs in olive. Also, protein characteristics, conserved domains, and subcellular localizations are investigated. According to the results, all olive CAMTA proteins are mainly localized in the nucleus as consistent with their roles, and all of them have 2 to 6 conserved domains which are also found in other plant CAMTAs. Additionally, a phylogenetic tree with 109 CAMTA proteins from well-knows plant species is constructed, and this tree showed that olive CAMTA proteins are highly conserved in plant kingdom.

Keywords: Calmodulin, CAMTA, Transcription Factor, Olive

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Anet 55 Şeftali Çeşidinin Depolanmasında Uçucu Yağ Emdirilmiş Modifiye Atmosfer Paketlemenin Kalite Özelliklerine Etkileri

Gi̇zem Alkın, Murat Şeker & Kenan Kaynaş

pp. 79 - 93   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.5

Abstract

Bu çalışma, şeftali meyvelerinin modifiye atmosfer paketleme (MAP) ile depolanmasında, uçucu yağ emdirilmiş torbaların kullanım olanağını saptamak amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla 28 Eylül 2021 tarihinde hasat edilen ANET 55 şeftali çeşidine ait meyveler Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi (ÇOMÜ) Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü mekanik soğutmalı araştırma odalarında 0±1°C sıcaklık ve %90±5 oransal nem koşullarında 60 gün süreyle depolanmış ve 15 gün arayla kalite özelliklerindeki değişim saptanmıştır Hasattan sonra 5 gruba ayrılan meyvelerde deneme kurulmuştur.1.grup meyvelere düşük yoğunlukta polietilen (LDPE) torbalar içerisinde MAP uygulaması yapılmıştır. 2.grup meyveler %0.5 dozunda kekik yağı (Thymus vulgaris L.), 3.grup meyveler %0.5 dozunda acı badem yağı (Prunus amygdalus var. amara) ve 4.grup meyveler ise kekik (%0.5) + acı badem yağı (%0.5) emdirilmiş MAP’larda depolanmıştır. 5.grup meyveler ise kontrol olarak ayrılmıştır. Depolama boyunca kontrol uygulamasına kıyasla tüm MAP uygulamalarının ağırlık kaybını önemli derecede azalttığı gözlemlenmiştir. Soğukta depolama sonunda meyve eti sertliğinin (MES) korunmasında hem uçucu yağ emdirilmiş MAP uygulamaları hem de tek başına MAP uygulaması kontrol meyvelerine göre oldukça etkili iken, en iyi sonuç kekik + acı badem yağı emdirilmiş MAP uygulanmış meyvelerde saptanmıştır. Kekik yağı emdirilmiş MAP uygulaması yapılan meyvelerde suda çözünebilir toplam kuru madde (SÇKM) miktarı, tek başına MAP uygulanmış meyvelerde ise titre edilebilir asitlik (TEA) değeri 60.güne kadar çok iyi korunmuş ve en iyi sonuçları vermiştir. Meyve renginin parlaklık (L*) ve chroma (C*) değerinin korunmasında uçucu yağ uygulamaları ve tek başına MAP uygulamaları kontrole göre daha başarılı bulunmuştur. Soğukta depolama sonunda en yüksek hue açısı* (h°*) değeri acı badem yağı emdirilmiş MAP uygulamasında saptanmıştır. Meyvelerde depolama süresince yapılan tadım testleri sonucunda kullanılan uçucu yağların meyve kokusunda değişime neden olmadığı gözlenmiştir. Bu araştırma sonucunda ANET 55 şeftali meyvesinin MAP ve uçucu yağ emdirilmiş MAP uygulamalarıyla %0.53 - %1.18 gibi çok düşük ağırlık kayıplarıyla 60 güne kadar başarılı bir şekilde depolanabileceği tespit edilmiştir. Ayrıca MAP teknolojisinde uçucu yağ uygulamalarının şeftali meyvesinde hasat sonrası kayıpları azaltmak ve kaliteyi korumak amacıyla kimyasal uygulamalara alternatif olabileceği görülmüştür.

Keywords: Modifiye Atmosfer Depolama, Kekik yağı, Acıbadem yağı, Raf ömrü

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Çanakkale’nin Eceabat Yöresinde Yetiştiriciliği Yapılan Zeytin Çeşitlerinin Pomolojik Özellikleri

Uğur Şahi̇n & Murat Şeker

pp. 94 - 106   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.6

Abstract

Bu araştırma Çanakkale’nin Eceabat yöresinde yetiştiriciliği yapılan Ayvalık, Gemlik ve Arbequina zeytin çeşitlerinin pomolojik özelliklerinin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Çalışmada bitki materyali olarak toplanan Ayvalık zeytin çeşidi Eceabat Merkez, Kocadere Köyü, Alçıtepe Köyü, Kum Otel ve Büyük Anafarta Köyünden, Gemlik zeytin çeşidi İsmetpaşa Mahallesi ve Büyük Anafarta Köyünden, Arbequina zeytin çeşidi Kocadere Köyünden alınmıştır. Her zeytin çeşidinin meyveleri 3 tekerrülü olacak şekilde incelenmiştir. Hasat edilen çeşitlerde meyve eni (mm), meyve boyu (mm), meyve ağırlığı (g), çekirdek eni (mm), çekirdek boyu (mm), çekirdek ağırlığı (g), meyve indeksi (boy/en), meyve/et oranı (%) ve olgunluk indeksi değerleri incelenmiştir. Her çeşit için varyans analizi yapılmış ve verilerin ortalamaları arasındaki farklılıkların karşılaştırılmasında LSD (P<0,05) testi kullanılmıştır. En yüksek meyve eni, meyve boyu, meyve ağırlığı, çekirdek boyu, meyve indeksi, meyve/et oranı ve olgunluk indeksi değerleri en yüksek Gemlik zeytin çeşidinde gözlenirken en yüksek çekirdek eni, çekirdek ağırlığı değerleri Ayvalık zeytin çeşidinde gözlenmiştir.

Keywords: (Olea europeae L.), Pomolojik ölçümler, Zeytin, Olgunluk indeksi

Original article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Femoral Patellar Eklem Yüzünün Morfometrik Analizi, Diz Eklemi Biyomekaniğinde Önem Arz Eder Mi?

Eda Duygu İpek, Nazli̇ Gulri̇z Ceri̇, Ömer Kızılay & Gizem Sakallı

pp. 107 - 115   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.7

Abstract

Ortopedik cerrahide yapılan total diz eklemi artroplastisinde ve adli antropolojide cinsiyet tayininde diz kapağı kemiği olan patella’nın morfometrik değerleri önem arz etmektedir. Bu çalışmada femoral patellar eklem yüzünün morfometrik parametrelerinin tespiti ve cinsiyet tayininde kullanılabilirliğinin araştırılması amaçlandı.

Cinsiyet kayıtları bilinen, toplamda 200 adet (100 kadın, 100 erkek) yetişkin femur kemiğinin ön yüzünün distalinde bulunan patellar eklem yüzü değerlendirildi. Medial ve lateral eklem yüzü genişliği, trohlear oluk uzunluğu, trohlear oluk açısı ve patellar eklem yüzü alanı ve femoral bikondiler genişlik ölçüldü, patellar eklem yüzü genişlik indeksi hesaplandı. Verilerin istatiksel analisi SPSS Version 22.0 programı ile gerçekleştirildi.

Trohlear uzunluk ve açı, femoral patellar eklem yüzünün alanı ve genişlik indeks değerlerinin sağ ve sol tarafa ait örneklerde cinsiyetler arasında istatiksel olarak anlamlı farklı oldukları tespit edildi. Medial eklem yüzü genişliği yalnızca sağ tarafta, erkeklerde yüksek bulundu. Sağ femoral patellar eklem yüzüne ait morfometrik parametreler kadın ve erkek cinsiyetlerini %78, sol tarafa ait morfometrik değerler ise %73 doğru olarak sınıflandırdı. Duyarlılık ve özgüllük değerleri göz önüne alındığında sağ ve sol tarafa ait örneklerde cinsiyet ayrımını en iyi sağlayan değerin trohlear uzunluk olduğu tespit edildi.

Çalışmamızda kadın ve erkek cinsiyetinin ayrımını en iyi sağlayan parametreler trohlear oluk uzunluğu, trohlear oluk açısı ve femoral patellar eklem yüzü alanı olarak bulundu. Diz eklemi biyomekaniği açısından femoral patellar eklem yüzünün patellar ölçümlerden farklılık gösterdiği tespit edildi.

Keywords: Facies patellaris (L.); Morfoloji; Cinsiyet Tayini, Biyomekanik

Review Articles

Review article | International Journal of Innovative Approaches in Science Research Vol. 6 (2)
Lens Tasarımcısının Optik Lens Geliştirme Süreçleri

Meli̇ke Güzi̇n Semerci̇oğlu

pp. 116 - 132   |  DOI: 10.29329/ijiasr.2022.454.8

Abstract

Teknolojinin gelişmesi ile bilgi işlem gücü artmış, bilimsel hesaplama yapma yeteneği de hızla gelişmiştir. Gelişen teknolojinin etkilediği alanlardan biri de optik alanıdır. Lens tasarımı, içerisinde lens optimizasyonu, ışın izi analizi, lens çizimi, modülasyon transfer fonksiyon hesaplamaları gibi birçok alt yapıyı içinde barındıran karmaşık bir çalışma alanıdır. Optik lens tasarımı, maliyet ve üretim sınırlamaları dahil olmak üzere bir dizi performans gereksinimini ve kısıtlamasını karşılayacak bir lens tasarlama sürecidir. Bu lens tasarım süresi, merceğin içinden geçen ışığın nasıl etkilendiğini modellemek için ışın izleme tekniğinin veya diğer tekniklerin kullanarak hesaplanması açısından oldukça karmaşıktır. Ancak optik ile ilgili yapılan çalışmalar incelendiğinde, birçok çalışmanın optik sistemler hakkında ayrıntılı bilgi verdikleri ancak lens tasarımı ve prosedürleri hakkında yeterli açıklama yapmadıkları belirlenmiştir. Bu çalışmada okuyucunun ışın izleme prosedürlerine, eksen dışı verilere ve üçüncü dereceden sapmalara aşina olduğu varsayılmaktadır. Ayrıca okuyucunun lens tasarımı ve analiz yapılmasına yönelik bir bilgisayar yazılımına erişimi olduğu varsayılmaktadır. Bu çalışma kapsamında, bir lensin tasarım sürecinin en başından, (son ürün olan) lensin çizimine kadar ki süreç ayrıntılı bir şekilde açıklanmaya çalışılmıştır. Araştırmanın literatüre katkı sağlayacağı düşünülmektedir.

Keywords: Lens tasarımı, Küresel ve küresel olmayan yüzeyler, İmalat toleransı, Optik camlar